Vojenský výzkumný ústav, s. p., je držitelem certifikátů a osvědčení:
VVÚ, s. p. je oprávněn:
- Nakládat s vysoce toxickými chemickými látkami (podle zákona č. 19/1997 Sb.), vybranými toxiny (podle zákona č. 281/2002 SB.), omamnými a psychoaktivními látkami (podle zákon č. 167/1998 Sb.), jadernými materiály a radionuklidy (podle zákona č. 263/2016 Sb.)
- Obchodovat s vojenským materiálem a odpovídajícími službami podle zákona č. 38/1994 Sb. a V č. 210/2012 Sb. ve všech oblastech své působnosti.
- Je držitelem zbrojní licence pro skupiny zbraní A, B, C dle zákona č. 119/2002 Sb., o zbraních a muniční licence, dle stejného ustanovení, která ho opravňuje k následujícím činnostem: výzkum, vývoj, výroba, ničení, nákup, prodej a skladování munice, znehodnocování a delaborace munice.
- Je držitelem Osvědčení podnikatele na stupeň TAJNÉ a NATO SECRET.